Nelle infezioni delle vie urinarie la procedura più importante consiste nella caratterizzazione dell’agente patogeno e nella conta dei batteri nelle urine.
A tale scopo le urine vanno raccolte quanto più asetticamente possibile utilizzando il campione intermedio cioè eliminando le urine emesse per prime e per ultime durante la minzione e utilizzando un recipiente sterile.

L’urinocoltura si considera negativa, quando il numero di colonie di batteri è inferiore a 10.000,dubbia fra 10.000 e 100.000, positiva per una conta superiore a 100.000 per millilitro.

L’esame viene completato con l’antibiogramma, in questo modo viene valutata, almeno in vitro, la sensibilità del microrganismo isolato a vari antibiotici che potrebbero essere utilizzati in vivo.